FoodCORE-Zentren und realer Einsatz von GI-CIDTs: Anpassung an Änderungen in der klinischen Diagnostik

Die Konsequenzen des vermehrten Einsatzes kulturunabhängiger diagnostischer Tests (CIDTs) für die Krankheitsüberwachung sind nicht mehr theoretisch, und die FoodCORE-Zentren nehmen Änderungen vor, um sicherzustellen, dass sie enterische Ausbrüche weiterhin effizient identifizieren und untersuchen können.

Was sind kulturunabhängige diagnostische Tests?

Kulturunabhängige diagnostische Tests (CIDTs) sind klinische Tests, die krankheitsverursachende Krankheitserreger identifizieren, um Ärzten bei der schnellen Diagnose und Behandlung von Krankheiten zu helfen. Krankenhäuser und Kliniken verwenden CIDTs, weil sie weniger arbeitsintensiv sind und schneller Ergebnisse liefern als herkömmliche Labortestmethoden. Einige CIDTs sind in der Lage, in nur einer Stunde mehr als 20 Krankheitserreger gleichzeitig zu testen, verglichen mit den Tagen, die zur Identifizierung eines einzelnen Krankheitserregers bei Verwendung herkömmlicher Bakterienkulturtests erforderlich sind. Laboratorien für öffentliche Gesundheit beginnen ebenfalls, diese Schnelltests zu verwenden und Wege zu finden, um die Technologie zur Verbesserung der Überwachung, Untersuchung und Reaktion von Ausbrüchen einzusetzen.

"CIDTs können die schnellen Antworten erhalten, die Ärzte benötigen, und die öffentliche Gesundheit kann zur Untersuchung von Ausbrüchen beitragen. Es ist jedoch eine Kultur erforderlich, um den Erreger mithilfe von PFGE oder WGS zu subtypisieren, einen Ausbruch zu identifizieren und festzustellen, ob der Erreger gegen Antibiotika resistent ist."

Dave Boxrud, MS
Molekularer Epidemiologe, Gesundheitsministerium von Minnesota

Warum sind CIDTs ein Problem für die öffentliche Gesundheit?

CIDTs können die Diagnosegeschwindigkeit verbessern, können jedoch die Fähigkeit eines öffentlichen Gesundheitslabors einschränken, Ausbrüche zu erkennen, da sie keine Isolate aus in Kultur gezüchteten Bakterien liefern. Laboratorien benötigen Isolate zur Durchführung der Pulsfeld-Gelelektrophorese (PFGE) oder der gesamten Genomsequenz (WGS), Labormethoden, mit denen Fälle verknüpft werden. Cluster werden identifiziert, wenn ein Labor für öffentliche Gesundheit PFGE-Muster oder WGS-Sequenzen vergleicht und zwei oder mehr Personen findet, die mit einem Bakterium mit demselben Muster oder einer ähnlichen Sequenz infiziert sind. PFGE-Muster und WGS-Sequenzen sind wie DNA-Fingerabdrücke. Wenn also Cluster von Personen gefunden werden, die mit demselben Muster oder derselben Sequenz infiziert sind, werden diese Personen wahrscheinlich aus einer gemeinsamen Quelle krank. Viele klinische Laboratorien verwenden hauptsächlich CIDTs, um die Zeit und Ressourcen, die für die Isolierung von Krankheitserregern durch Kultur erforderlich sind, auf Laboratorien für das öffentliche Gesundheitswesen zu verlagern und die sofortige und gründliche Erkennung von Ausbrüchen zu beeinträchtigen. Darüber hinaus können Laboratorien ohne Isolate Krankheitserreger nicht auf Antibiotikaresistenz testen. Antibiotikaresistenztests sind nicht nur wichtig für die Überwachung der öffentlichen Gesundheit, sondern auch wichtig, um sicherzustellen, dass Patienten effektiv behandelt werden.

Wie passen sich FoodCORE-Zentren an CIDT an?

Der vermehrte Einsatz von CIDTs in Krankenhäusern und klinischen Labors bedeutet, dass sich die öffentliche Gesundheit an die neue Technologie anpassen muss. Ein Ansatz bestand darin, Kliniken und Krankenhäuser zu ermutigen, klinische Proben (Stuhlproben) an das staatliche Gesundheitslabor zu senden, nachdem sie eine Diagnose mit CIDT erhalten haben. Einige Gerichtsbarkeiten, einschließlich einiger FoodCORE-Zentren, haben ihre Gesetze und Vorschriften dahingehend aktualisiert, dass entweder klinische Laboratorien CIDT-positive klinische Proben zur Kultur an das Labor für öffentliche Gesundheit senden müssen oder dass die klinischen Laborkulturproben Proben mit positiven CIDT-Ergebnissen enthalten müssen (dieser Prozess wird als Prozess bezeichnet) Reflexkultur). Andere arbeiten daran, klinische Laboratorien über die Bedeutung der Isolierung von Krankheitserregern aufzuklären. Mit dieser Ausbildung machen es einige Kliniken und Krankenhäuser nun zur Priorität, klinische Proben an Laboratorien für öffentliche Gesundheit zu senden, und einige sind sogar bereit, zusätzlich zu CIDTs Kulturtests durchzuführen, um die öffentliche Gesundheit zu unterstützen.

Wie haben CIDTs FoodCORE-Zentren geholfen?

Trotz Bedenken hinsichtlich der Auswirkungen von CIDTs auf die Überwachung der öffentlichen Gesundheit haben sie sich als nützlich für einige Bedürfnisse der öffentlichen Gesundheit erwiesen. FoodCORE-Zentren haben CIDT-Ergebnisse verwendet, um die Ursache von Ausbrüchen zu ermitteln, die durch routinemäßige klinische Überwachung nicht identifiziert wurden. Ausbrüche aufgrund ungewöhnlicher Krankheitserreger zu finden; und um Partnern, Medien und der Öffentlichkeit schnell Informationen zur Verfügung zu stellen.

Ermittlung der Ursachen von Ausbrüchen

Die Gesundheitsbehörden können nicht immer feststellen, welche Krankheitserreger Menschen krank gemacht oder einen Ausbruch verursacht haben. Die Zeit und die Ressourcen, die erforderlich sind, um auch nur wenige Krankheitserreger zu testen, erschweren es den meisten Labors, alle potenziellen Krankheitserreger zu testen. Aus diesem Grund kann es lange dauern, Krankheitserreger zu identifizieren, die einige Ausbrüche verursachen, und in einigen Fällen wird der Krankheitserreger möglicherweise nie identifiziert. Mit der Verwendung von CIDT können Laboratorien des öffentlichen Gesundheitswesens schnell und einfach gleichzeitig auf eine breite Palette von Krankheitserregern testen.

Die Website von Minnesota FoodCORE untersuchte einen Ausbruch im Herbst 2015, der festgestellt wurde, als Mitglieder der Öffentlichkeit nach dem Essen in einem Pizzarestaurant anriefen, um Krankheiten zu melden. Symptominformationen allein reichten nicht aus, um festzustellen, welcher Erreger die Menschen krank machte, aber durch die Durchführung einer CIDT konnten sie schnell feststellen, dass es sich um eine atypische enteropathogene Erkrankung handelte E colioder EPEC, ein Krankheitserreger, der üblicherweise nicht auf Ausbrüche getestet oder damit in Verbindung gebracht wird. Die Kenntnis des Erregers, der den Ausbruch verursachte, ermöglichte es Epidemiologen und Umweltgesundheitsspezialisten in Minnesota, ihre Untersuchungen und Reaktionen schnell und genau zu fokussieren.

Weitere Ausbrüche finden

In der Vergangenheit konnten klinische Laboratorien nur von Fall zu Fall auf ungewöhnliche Krankheitserreger testen, und erst nachdem andere häufigere Krankheitserreger aufgrund restriktiver Kosten und der Komplexität der routinemäßigen Durchführung diagnostischer Tests ausgeschlossen worden waren. Diese Lücke in der Testfähigkeit machte es schwierig, Ausbrüche von Infektionen mit weniger häufigen Krankheitserregern zu identifizieren.

Im Frühjahr 2015 begann ein Krankenhaus im Nordosten von Wisconsin routinemäßig mit der Verwendung von CIDTs, um die Diagnose von Krankheiten bei Patienten mit Durchfall zu unterstützen. In diesem Jahr identifizierte das Krankenhaus neun infizierte Personen Cyclospora, ein Krankheitserreger, auf den das Krankenhaus vor der Verwendung von CIDTs nicht routinemäßig getestet hatte. Nach Befragung von Patienten erfuhren die FoodCORE-Epidemiologen, dass alle bis auf einen im selben Restaurant aßen, und stellten fest, dass kontaminierter Koriander die Ursache für diesen Ausbruch war. Wenn das Krankenhauslabor keine CIDTs verwendet hätte, wäre der Ausbruch möglicherweise nicht entdeckt worden, oder er hätte viel später gefunden werden können, nachdem mehr Menschen krank geworden waren.

Schnelleres Abrufen von Informationen

Besuchen Sie diese Websites, um weitere Informationen zu Labortests und CIDTs zu erhalten:

CIDT Grand Rounds: Änderungen in der klinischen Diagnostik und Verfolgung von Infektionskrankheiten

PulseNet: Die Zukunft von PulseNet

FoodNet: Lebensmittelbedingte Krankheits- und kulturunabhängige Diagnosetests (CIDTs)

Labormodellpraxis: FoodCORE-Modellpraxis: Aktualität und Vollständigkeit des Labors Cdc-pdf [PDF - 5 Seiten]

Colorado CoE Lab Training: Lab SeriesExternal

APHL: Interim Guidelines on CIDTs Cdc-pdf [PDF - 4 Seiten] Extern

Seit Jahren gilt PFGE als Goldstandard für die Verknüpfung von Fällen lebensmittelbedingter Krankheiten und das Auffinden von Ausbrüchen. Die Verwendung von PFGE bietet viele Vorteile, erfordert jedoch Bakterienisolate. CIDTs identifizieren Krankheitserreger schneller, was zu schnelleren Maßnahmen im Bereich der öffentlichen Gesundheit und zur Verhinderung zusätzlicher Fälle führt. Das Warten auf Kulturergebnisse kann für Beamte des öffentlichen Gesundheitswesens schwierig sein, wenn Medien, Öffentlichkeit und andere Mitglieder ihrer Untersuchungsteams Druck ausüben, um schneller Informationen zu erhalten.

Im Herbst 2015 untersuchte die Oregon FoodCORE-Website einen Ausbruch von E coli verbunden mit einem mexikanischen Restaurant. Obwohl PFGE erforderlich war, um festzustellen, ob kranke Personen die Definition des Ausbruchsfalls erfüllten, konnten die Forscher mithilfe von CIDTs schnell nach potenziellen neuen Fällen suchen, um das Vorhandensein von Toxingen zu identifizieren stx1 und stx2. Dies beschleunigte die Reaktion auf den Ausbruch und ermöglichte es den Ermittlern, schneller Maßnahmen zu ergreifen.

CIDTs trugen auch dazu bei, die Reaktion der FoodCORE-Site in South Carolina auf einen möglichen Ausbruch zu beschleunigen, als sie in einer Kindertagesstätte über eine Gruppe von Magen-Darm-Erkrankungen informiert wurden. Die Untersuchung ergab, dass sieben Kinder und zwei Mitarbeiter krank waren. Drei Stuhlproben wurden zum Testen an das Labor für öffentliche Gesundheit geschickt. Unter Verwendung von CIDT identifizierten die Laboranten das Sapovirus in den Proben. Das Sapovirus verursacht Durchfall und Erbrechen, die sich in der Regel innerhalb weniger Tage ohne Behandlung bessern. Mit diesen Informationen könnte die FoodCORE-Website der Kindertagesstätte innerhalb einer Woche die Ursache des Ausbruchs mitteilen. Diese schnelle Diagnose half, die Eltern zu informieren und die Befürchtungen über einen schwerwiegenderen Erreger zu lindern. Vor der CIDT hätte das Labor über mehrere Tage eine Reihe von Tests auf virale und bakterielle Krankheitserreger durchführen müssen, und selbst dann hätten herkömmliche Tests diesen Krankheitserreger nicht identifiziert.

Was kommt als nächstes?

Bis es möglich ist, Fälle zu verknüpfen und die Antibiotikaresistenz ohne Isolat zu bestimmen, werden CIDTs weiterhin ein Anliegen für die Überwachung und Untersuchung enterischer Krankheiten sein. Da immer mehr klinische Laboratorien CIDTs verwenden, wird das Risiko, wertvolle Informationen aus dem Isolat wie PFGE-Muster oder WGS-Sequenzen zu verlieren, ein wachsendes Problem sein. Viele Laboratorien für öffentliche Gesundheit werden die Last der Kultivierung von Proben übernehmen. Dieser Prozess ist langsam, teuer und angesichts der derzeitigen Infrastruktur der öffentlichen Gesundheitslabors wahrscheinlich nicht nachhaltig.

Zusätzliche Herausforderungen bestehen darin, CIDT-Berichte von Krankenhäusern zu erhalten, das Potenzial für den Verlust der Lebensfähigkeit von Krankheitserregern während des Transports zum Labor für öffentliche Gesundheit, die Festlegung von Falldefinitionen bei Ausbrüchen und die Übermittlung von CIDT-positiven Ergebnissen an Patienten, wobei Patienten von der Arbeit in Umgebungen mit hohem Risiko ausgeschlossen werden, wie z Tagesstätten oder Restaurants und Interpretation von Ergebnissen, die für mehrere Krankheitserreger positiv sind. Diese Bedenken sollten sorgfältig gegen die Vorteile abgewogen werden, die CIDTs Klinikern und Ärzten des öffentlichen Gesundheitswesens bieten können. Die FoodCORE-Zentren werden weiterhin Erfahrungen mit anderen staatlichen und lokalen Gesundheitsabteilungen austauschen, die mit den realen Auswirkungen von CIDTs arbeiten.

Download: FoodCORE-Zentren und reale Verwendung von GI-CIDTs: Anpassung an Änderungen in der klinischen Diagnostik Cdc-pdf [PDF - 3 Seiten]