Wie funktioniert MicrobeNet?

Schritt 1: Das Labor hat ein unbekanntes Isolat und züchtet es auf Agarwachstumsplatten zur morphologischen Charakterisierung (Größe, Form und Farbe der Kolonien).

Schritt 2: Das Labor führt sein biochemisches Standardpanel durch.

Schritt 3: Das Labor führt eine DNA-Analyse durch (genetische 16S-Sequenz).

Schritt 4: Der Laborwissenschaftler meldet sich bei MicrobeNet an, eröffnet ein neues Projekt, wählt geeignete Ergebnisse der biochemischen Analyse aus der verfügbaren Liste von mehr als 190 häufig verwendeten Referenzdiagnosetests aus und gibt andere verfügbare Daten ein (Morphologie, Antibiotikaresistenz).

Schritt 5: Wenn eine 16S-Gensequenzanalyse durchgeführt wurde, kann der Laborwissenschaftler die Ergebnisse der Analyse direkt kopieren und in MicrobeNet einfügen, um mithilfe eines Tools namens BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) passende Sequenzen zu finden.

Schritt 6: MicrobeNet erstellt eine Liste der engsten Übereinstimmungen basierend auf den bereitgestellten Eingaben und schlägt weitere Tests vor, wenn die Ergebnisse nicht übereinstimmen oder nicht schlüssig sind.

Schritt 7: Laborwissenschaftler können CDC-Experten konsultieren, um bei der Identifizierung zu helfen.

Letzter Schritt: Sobald der Erreger identifiziert ist, kann der Laborwissenschaftler dem Arzt des Patienten Informationen zur Verfügung stellen. Diese Informationen können dem Arzt helfen, die richtige Diagnose zu stellen und die geeignete Behandlung zu geben.

MicrobeNet kann dabei helfen, einen seltenen Erreger anhand einiger weniger kostengünstiger, leicht verfügbarer und regelmäßig durchgeführter biochemischer Tests zu identifizieren, die genauer sind als die derzeit von Laboratorien verwendeten Methoden, z. B. instrumentenbasierte oder selbst erstellte Erregerdatenbanken und Bibliotheken, die möglicherweise nicht alle seltenen und gefährlichen enthalten Krankheitserreger, die häufig nicht richtig identifiziert werden und ein falsches Ergebnis liefern. In der MicrobeNet-Bibliothek sind alle Daten zu vielen Krankheitserregern aus der CDC-Sammlung seltener Mikroben enthalten, darunter Bilder, Ergebnisse des biochemischen Panels, Informationen zur 16S-rRNA-Sequenz und schließlich ganze Genomsequenzen und Proteinprofile.

Um die Reproduzierbarkeit der Ergebnisse zu verbessern, enthält MicrobeNet Informationen zu Standardverfahren, die von CDC-Wissenschaftlern entwickelt wurden und die beschreiben, wie die Krankheitserreger gezüchtet werden und wie sie am besten getestet werden können. Dies verkürzt die Zeit, die zur Identifizierung von Krankheitserregern benötigt wird, da das Labor keine Proben an das CDC-Labor senden oder auf die Analyse warten muss. Dies spart Laboratorien Zeit und Geld.

Laboratorien für öffentliche Gesundheit auf der ganzen Welt können diagnostische Tests durchführen und ihre Ergebnisse mit der einzigartigen Sammlung von Krankheitserregern der CDC vergleichen. Dies sind oft Mikroben, die schwere Krankheiten verursachen, aber schwer zu züchten, zu testen und zu identifizieren sind.MicrobeNet bietet Labors eine zuverlässige Möglichkeit, seltene Krankheitserreger unabhängig vom Stand der Technik im diagnostischen Labor schnell und korrekt zu identifizieren.